2024年2月27日,國家感染性疾病臨床研究中心/深圳市第三人民醫院張國良、盧水華團隊,聯合深圳華大基因吳靚團隊、廣西胸科醫院劉愛梅團隊,利用單細胞測序技術成功繪制HIV-1/Mtb共感染人群肺臟“區域”免疫圖譜,為深入闡明HIV-1感染人群結核發病的免疫機制奠定理論基石。相關研究成果發表在美國傳染病學會(IDSA)旗下雜志Journal of Infectious Diseases,題為“Uncovering the Bronchoalveolar Single-Cell Landscape of Patients With Pulmonary Tuberculosis With Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coinfection”(DOI:10.1093/infdis/jiae042)。
HIV-1感染是導致結核發病的最重要危險因素。由于臨床樣本采集方面的挑戰,大多數宿主抗結核免疫的研究主要集中在外周血,而外周血主要反映全身免疫反應,不能真實的反映出肺部的“區域”免疫特征。肺部區域免疫應答對于遏制結核分枝桿菌的生長和防止疾病的進展至關重要,對肺部區域免疫應答的全面解析對于更好地了解HIV-1/Mtb合并感染的發病機制至關重要。本研究共招募肺結核(TB)患者和HIV-1/Mtb共感染患者,通過支氣管鏡技術收集患者的肺泡灌洗液(BALF),并立即進行單細胞分離。利用華大自主研發的便攜式DNBeLab C4單細胞處理系統對進行單細胞轉錄組文庫制備,并在華大自主研發的測序儀DIPSEQ T1上進行測序。
該研究通過單細胞測序技術詳細描繪了HIV-1/Mtb共感染和單純TB患者肺泡灌洗液中的免疫細胞圖譜。進一步根據差異表達的標識基因,將髓系細胞和T/NK細胞分別細分為10個細胞亞群。研究發現HIV-1感染顯著降低結核患者肺部CD4+ T細胞和DCs細胞的比例,但顯著提高CD8+ T細胞的比例。同時該研究表明HIV-1/Mtb共感染患者中的T細胞表現出更強的抗病毒活性,表明HIV-1感染不僅影響結核患者肺部免疫細胞亞群的分布特征,更影響免疫細胞的效應功能。
該研究得到國家重點研發計劃、國家自然科學基金、廣東省特支計劃、深圳市科技計劃以及廣西省科技計劃的支持。國家感染性疾病臨床醫學研究中心/深圳市第三人民醫院肖國輝副研究員,華大基因黃外東、鐘裕博士,深圳市第三人民醫院歐敏助理研究員為本文共同第一作者。